港股通交易确实会收取佣金，这是券商按成交金额的一定比例收取的费用，投资者在通过港股通进行股票买卖时需要支付给券商的交易费用。与A股的“万一免五”（即佣金按万分之一收取，且单笔最低五元，部分券商可能免收单笔最低五元的费用）相比，港股通交易的佣金制度存在显著差异。
港股通佣金制度
港股通的佣金收费标准并不是固定不变的，通常受到多种因素的影响，包括但不限于券商的政策、投资者的资金量、交易频率等。一般来说，港股通的佣金费率默认在万分之三左右，但最低可以做到万分之零点五甚至更低，这取决于券商提供的优惠政策以及投资者与券商之间的协商结果。
除了佣金外，港股通交易还会涉及其他费用，包括股票印花税（每宗交易金额的0.1%，支付予香港***）、交易徵费（每宗交易金额的0.003%，支付予***，也有说法是成交额的0.0027%，双边征收）、交易费（每宗交易金额的0.005%，支付予交易所，也有说法是按成交额的0.00565%计收）、中央结算收费（每宗交易金额的0.002%，支付予结算所，最低港币2元，最高港币100元）等。这些费用都是按照交易金额的一定比例来计算的，并且与佣金一样，在交易时会被扣除。
与A股“万一免五”的区别
1. 费率差异：A股的“万一免五”佣金费率相对较低，而港股通的佣金费率则可能因券商和协商结果的不同而有所变化，但通常不会低于万分之一。此外，港股通交易还需要支付其他多项费用，如印花税、交易徵费等，而A股交易则可能只涉及佣金和过户费等少数几项费用。
2. 计算方式：A股的“万一免五”通常指的是佣金费率按万分之一计算，且单笔交易佣金不满五元时按五元收取（部分券商可能免收这一费用）。而港股通的佣金则是按照交易金额的一定比例来计算，并且没有单笔最低佣金的限制（但券商可能会设定最低收费金额）。
3. 交易制度：港股通实行T+0回转交易和T+2交收制度，而A股则通常实行T+1交易制度（即当天买入的股票不能当天卖出）。这种交易制度的差异也可能影响投资者的交易策略和佣金成本。
综上所述，港股通交易的佣金制度与A股的“万一免五”存在显著差异。投资者在选择港股通交易时，需要充分了解佣金和其他费用的收费标准以及交易制度的特点，以便更好地制定交易策略和控制交易成本。