在当前的市场环境中，股票交易的费用主要包括佣金、印花税、过户费以及其他一些可能产生的费用（如经手费、证管费等）。针对股票交易费率是否有低于万分之一（0.01%）的情况，以下进行具体分析：
一、佣金
佣金是投资者通过证券公司进行股票买卖时需支付的费用，这是股票交易中最常见的费用之一。
1. 费率水平：目前，市场上主流的佣金费率大致在万分之三（0.03%）左右，这是大多数证券公司对普通投资者提供的默认佣金水平。但佣金费率并非固定不变，投资者可以与证券公司或其客户经理进行协商，特别是对于资金量较大、交易活跃度较高的投资者，券商可能会提供更低的佣金费率。一些中小券商为了扩大市场占有率，也会提供低佣金吸引开户。
2. 最低收费限制：许多证券公司设定了每笔交易的最低收费门槛，通常为5元人民币。即使按佣金率计算出的佣金金额低于此数，也会按5元收取。
3. 特定渠道优惠：一些证券公司针对特定客户群体或通过特定开户渠道（如联系客户经理在线开户）提供低佣金账户，佣金费率可能会低于默认标准。理论上，佣金可以低至万分之三以下，但直接申请低于万一费率的账户较为困难，因为这属于超低费率，通常针对资金量大的投资者，且需要在开通前与客户经理进行协商，经过双方同意后才可以办理。
二、印花税
印花税是国家税务部门对股票交易征收的一种税费，仅在股票卖出时收取。税率为成交金额的0.5‰（即万分之五），由证券公司代扣代缴给国家税务总局。需要注意的是，投资基金、债券或其他金融衍生品时不征收印花税。
三、过户费
过户费是股票成交后，为更换户名而支付的费用。过户费由中国证券登记结算有限责任公司收取，证券公司代收。
1. 上海证券交易所：按成交金额的0.01‰（即万分之0.1）双向收取。
2. 深圳证券交易所：通常免收过户费。
四、其他费用
其他可能产生的费用包括通讯费、委托费、撤单费等，但这些费用通常已包含在券商佣金中，不再单独收取。
综上所述，股票交易的费率中，佣金存在低于万分之一（0.01%）的可能性，但这通常针对资金量较大、交易活跃度较高的投资者，并需要在开通前与证券公司的客户经理进行协商。而印花税和过户费则按照固定的费率标准收取，不存在低于万分之一的情况。因此，投资者在进行股票交易时，应综合考虑各种费用，并根据自己的资金量和交易习惯选择合适的证券公司和服务。